นิพนธ์ต้นฉบับ : การวิเคราะห์โปรตีโอมิกส์ในปัสสาวะของผู้ป่วยเอชไอวีที่ติดเชื้อวัณโรค

Abstract

วัตถุประสงค์ เพื่อศึกษารูปแบบการแสดงออกของโปรตีนจากปัสสาวะของผู้ป่วยเอชไอวีที่ติดเชื้อวัณโรค ด้วย เทคนิคโปรตีโอมิกส์ เพื่อค้นหาตัวบ่งชี้ทางชีวภาพ วิธีการศึกษา ศึกษาโดยแบ่งเก็บตัวอย่างปัสสาวะเป็น 4 กลุ่ม คือ (1) กลุ่มผู้ป่วยเอชไอวีที่ติดเชื้อวัณโรคปอด ประเภทพบเชื้อ (2) กลุ่มผู้ป่วยเอชไอวีที่ติดเชื้อวัณโรคปอดประเภทไม่พบเชื้อ (3) กลุ่มผู้ป่วยเอชไอวีที่ติดเชื้อ วัณโรคนอกปอด และ (4) คนปกติ แยกโปรตีนในแต่ละตัวอย่างโดยวิธี SDS-PAGE ทําการย้อมเจล ตัดแบ่ง เจล และย่อยโปรตีนภายในเจลด้วยเอนไซม์ทริปซิน วิเคราะห์ชนิดและปริมาณของเปปไทด์ด้วยเทคนิค LCMS/MS แล้วระบุชนิดของโปรตีนโดยเทียบกับโปรตีนในฐานข้อมูล ผลการศึกษา พบโปรตีนของเชื้อวัณโรคในปัสสาวะที่แสดงออกแตกต่างกันทั้งหมด 193 ชนิด เปรียบเทียบ การแสดงออกของโปรตีนในปัสสาวะผู้ป่วยเอชไอวีที่ติดเชื้อวัณโรคทุกประเภทกับคนปกติ ไม่พบว่ามีโปรตีน 30S ribosomal protein S15 rpsO, lipoprotein 39 kDa, PE family-related protein และ predicted protein (gi|289445817) ในปัสสาวะของกลุ่มผู้ป่วยเอชไอวีที่ติดเชื้อวัณโรค แต่เมื่อเปรียบเทียบการแสดงออก ของโปรตีนในปัสสาวะผู้ป่วยเอชไอวีที่ติดเชื้อวัณโรคแยกแต่ละประเภทกับคนปกติ ไม่พบโปรตีน transcriptional regulator protein EmbR ทั้งประเภทพบเชื้อและไม่พบเชื้อ แต่แสดงออกเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสําคัญใน กลุ่มผู้ป่วยเอชไอวีที่ติดเชื้อวัณโรคนอกปอด สรุปผลการศึกษา โปรตีนของเชื้อวัณโรคที่น่าจะเป็นโปรตีนเป้าหมายและอาจใช้เป็นตัวบ่งชี้สําหรับวินิจฉัย วัณโรคในผู้ป่วยเอชไอวีได้ คือ 30S ribosomal protein S15 rpsO และ lipoprotein 39 kDa และอาจจะ ใช้โปรตีน transcriptional regulator protein EmbR วินิจฉัยแยกวัณโรคในปอดและนอกปอด