ความหลากหลายของจุลินทรีย์และนิเวศวิทยาในกระเพาะรูเมนของกระบือปลักที่ได้รับฟางข้าวหรือหญ้าขนสด

Abstract

การศึกษาความหลากหลาย ลละจำนวนประชากรของลบคทีเรียที่อาศัยอยู่ในกระเพาะรูเมนของกระบือปลักที่ได้รับฟางข้าวหรือหญ้าขนสด โดยการวิเคราะห์ลาดับเบสของยีน 16S rDNA โดยใช้กระบือปลักโตเต็มวัย เพศเมีย จำนวน 4 ตัว ที่เจาะกระเพาะรูเมน ทาการเก็บตัวอย่างจากกระเพาะรูเมนเพื่อนามาสกัด DNA ของลบคทีเรียลละนำไปวิเคราะห์ความหลากหลายของลบคทีเรียโดยใช้เทคนิค PCR ลละการทาห้องสมลดยีนของ 16S rDNA (1,500 bp) ทาการหาจานวนประชากรของลบคทีเรียโดยใช้เทคนิค real-time PCR ลละนาลาดับเบสของยีน 16S rDNA ที่ได้จากการโคลนมาเปรียบเทียบกับฐานข้อมูลใน GenBank โดยวิธี on line BLAST จากการสล่มโคลนของยีน 16S rDNA จากกระเพาะรูเมนของกระบือที่กินฟางข้าว จำนวน 102 โคลน พบโคลนที่มีความเหมือนกับลบคทีเรียในฐานข้อมูลมากกว่า 97 เปอร์เซ็นต์ คิดเป็น 49.02 เปอร์เซ็นต์ (50 โคลน) ลละลบคทีเรียที่มีความเหมือนน้อยกว่า 97 เปอร์เซ็นต์ คิดเป็น 50.98 เปอร์เซ็นต์ (52 โคลน) ของลบคทีเรียทั้งหมดในห้องสมลดยีน ลบคทีเรียกลล่มหลักที่พบ คือ ลบคทีเรียกลล่ม Low G+C Gram-Positive Bacteria (LGCGPB) คิดเป็น 71.57 เปอร์เซ็นต์ ในขณะที่การโคลนยีน 16S rDNA จากกระเพาะรูเมนของกระบือที่กินหญ้าขนสด จำนวน 109 โคลน พบโคลนที่มีความเหมือนกับลบคทีเรียในฐานข้อมูล มากกว่า 97 เปอร์เซ็นต์ คิดเป็น 40.37 เปอร์เซ็นต์ (44 โคลน) ลละลบคทีเรียที่มีความเหมือนน้อยกว่า 97 เปอร์เซ็นต์ คิดเป็น 59.63 เปอร์เซ็นต์ (65 โคลน) ของลบคทีเรียทั้งหมดในห้องสมลดยีน ลบคทีเรียกลล่มหลักที่พบ คือ ลบคทีเรียกลล่ม LGCGPB คิดเป็น 56.88 เปอร์เซ็นต์ จำนวนประชากรของลบคทีเรียกลล่มหลักที่พบได้บ่อยในกระเพาะรูเมนของกระบือที่ได้รับฟางข้าวหรือหญ้าขนสดมีปริมาณใกล้เคียงกัน