Please use this identifier to cite or link to this item: http://cmuir.cmu.ac.th/jspui/handle/6653943832/78585
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorKorakot Nganvongpanit-
dc.contributor.advisorSiriwadee Chomdej-
dc.contributor.advisorJatupol Kampuansai-
dc.contributor.authorWareerat Prasitwiseten_US
dc.date.accessioned2023-07-25T15:14:54Z-
dc.date.available2023-07-25T15:14:54Z-
dc.date.issued2023-01-
dc.identifier.urihttp://cmuir.cmu.ac.th/jspui/handle/6653943832/78585-
dc.description.abstractIndo-Pacific bottlenose dolphins (Tursiops aduncus) are a coastal dolphin found in Thai waters, off the coasts of the Gulf of Thailand and the Andaman Sea. This species was recently re-listed as near-threatened by the IUCN Red List, though the population status in Thai seas is not known. Here, to investigated genetic diversity, population structure, maternal lineage, and demographics by analyzing skin tissue samples (n = 30) of T. aduncus stranded along the Andaman coastline of Thailand between 1990 and 2019. This study was based on 11 microsatellite loci and 265 bp mtDNA control regions compared to data available through the National Center for Biotechnology Information (NCBI). From microsatellites, the observed heterozygosity (Ho) ranged from 0.46 to 0.85. The mean fixation index (F) value for all loci was 0.10 ± 0.04, which suggests some degree of inbreeding. Two genetic clusters (the most likely K at K = 2) were observed in T. aduncus through the population structure analysis using multiple criteria. For the mtDNA control region, a total of 17 haplotypes were found for dolphins in Thai seas (14 haplotypes from samples in this study; three haplotypes from the NCBI database) with high levels of haplotype diversity (h) at 0.926 ± 0.027 and nucleotide diversity (π) at 0.045 ± 0.002. A decline in the effective population size from 0.05 million years ago also was observed in Thai T. aduncus through Bayesian Skyline Plots analysis. A unique set of haplotypes was identified in samples of this study, which may have originated from the Australian and Indian Oceans rather than the Western Pacific Ocean. These results enhance knowledge of the maternal lineage of the Indo-Pacific bottlenose dolphin, which can be used for monitoring population status and establishing better conservation plans for this species in the Thai Andaman Sea.en_US
dc.language.isoenen_US
dc.publisherChiang Mai : Graduate School, Chiang Mai Universityen_US
dc.titleMicrosatellite and mitochondrial DNA variations of Indo-Pacific bottlenose dolphin (Tursiops aduncus) in the Andaman sea of Thailanden_US
dc.title.alternativeความหลากหลายไมโครแซทเทลไลท์และไมโทรคอนเดรียดีเอ็นเอของโลมาปากขวดอินโดแปซิฟิก (Tursiops aduncus) ในทะเลอันดามันของประเทศไทยen_US
dc.typeThesis
thailis.controlvocab.lcshIndo-Pacific bottlenose dolphins-
thailis.controlvocab.lcshTursiops aduncus-
thailis.controlvocab.lcshMitochondrial DNA-
thailis.controlvocab.lcshMicrosatellites (Genetics)-
thesis.degreemasteren_US
thesis.description.thaiAbstractโลมาปากขวดอินโดแปซิฟิก (Tursiops aduncus) เป็นชนิดพันธุ์ชายฝั่งที่พบในน่านน้ำไทยบริเวณนอกชายฝั่งทะเลอันดามันและอ่าวไทย โลมาชนิดนี้เพิ่งถูกขึ้นบัญชีใหม่ว่าใกล้ถูกคุกคามโดย IUCN แม้ว่าจะยังไม่ทราบสถานะประชากรในทะเลไทยก็ตาม การศึกษานี้ได้ทำการตรวจสอบความหลากหลายทางพันธุกรรม โครงสร้างประชากร และเชื้อสายทางมารดา โดยการวิเคราะห์ตัวอย่างชิ้นเนื้อ 30 ตัวอย่าง ของโลมาปากขวดอินโดแปซิฟิกที่เกยตื้นตามแนวชายฝั่งทะเลอันดามันของประเทศไทยระหว่างปี พ.ศ. 2533-2562 โดยใช้เครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์ 11 ตำแหน่ง และเปรียบเทียบลำดับนิวคลีโอไทด์ของดีเอ็นเอไมโทคอนเดรียส่วน D-loop ขนาด 265 นิวคลีโอไทด์ ของโลมาปากขวดไทยกับทั่วโลกจากฐานข้อมูล NCBI ผลจากไมโครแซทเทลไลท์ พบว่าเฮเทอโรไซโกซิตี (Ho) ที่สังเกตได้มีค่าอยู่ในช่วง 0.20 ถึง 0.85 ค่า Fixation index เฉลี่ยสำหรับตำแหน่งทั้งหมดเท่ากับ 0.24 ± 0.07 ซึ่งบ่งชี้ถึงระดับการผสมพันธุ์ภายในกลุ่มที่ต่ำ การวิเคราะห์โครงสร้างประชากรพบว่ากลุ่มตัวอย่างแบ่งตามพันธุกรรมออกได้เป็นสองกลุ่ม (ΔK = 2) สำหรับเครื่องหมายดีเอ็นเอไมโทคอนเดรีย พบแฮโปลไทป์ ทั้งหมด 17 ชนิดสำหรับโลมาในทะเลไทย (14 haplotypes จากตัวอย่างในการศึกษานี้; และ 3 แฮโปลไทป์ จากฐานข้อมูล NCBI) โดยมีความหลากหลายแฮโปลไทป์ ระดับสูง (h 0.926 ± 0.027) และความหลากหลายของนิวคลีโอไทด์ (π) เท่ากับ 0.045 ± 0.002 การวิเคราะห์ Bayesian Skyline Plots พบการลดลงของขนาดประชากรเมื่อ 5 หมื่นปีก่อนในโลมาปากขวดอินโดแปซิฟิกของไทย ตัวอย่างจากการศึกษานี้มีแฮโปลไทป์ที่ไม่พบในประชากรใดมาก่อน โดยอาจมีต้นกำเนิดมาจากมหาสมุทรออสเตรเลียและมหาสมุทรอินเดีย แทนที่จะเป็นมหาสมุทรแปซิฟิกตะวันตก ผลลัพธ์เหล่านี้ช่วยเพิ่มความเข้าใจเกี่ยวกับเชื้อสายทางมารดาของโลมาปากขวดอินโดแปซิฟิก ซึ่งสามารถใช้ในการตรวจสอบสถานะประชากรและกำหนดแผนการอนุรักษ์ที่ดีขึ้นสำหรับปลาโลมาชนิดนี้ในทะเลอันดามันของไทยen_US
Appears in Collections:VET: Theses

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
641435907-WAREERAT PRASITWISET.pdf1.8 MBAdobe PDFView/Open    Request a copy


Items in CMUIR are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.